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中国西南地区甘薯主要育种亲本的遗传多样性及群体结构分析

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文献出处
中国农业科学  2016年03期
关键词
甘薯论文  遗传多样性论文  群体结构论文  农艺性状论文  品质性状论文
论文摘要

【目的】探究中国西南地区主要甘薯育种亲本材料的遗传多样性和群体结构,为甘薯亲本材料的保存和利用、甘薯分子标记辅助选择提供参考依据。【方法】利用61个SSR分子标记、13个农艺性状和6个品质性状,对82份中国西南地区主要甘薯育种亲本材料进行遗传多样性分析。利用NTSYS-pc 2.10数据处理软件,分别根据SSR分子标记数据、品质性状、农艺性状计算82份亲本材料的Nei72遗传距离矩阵。利用Mega 6.06数据处理软件,计算82份材料基于SSR分子标记、品质性状、农艺性状的平均遗传距离。利用NTSYS-pc 2.10软件,对供试材料基于SSR标记、品质性状和农艺性状的遗传距离矩阵进行相关性分析。根据遗传距离矩阵,利用Mega6.06软件分别对82份亲本材料进行基于品质性状的类平均法(unweighted pair group method with arithmetic mean,UPGMA)聚类分析、基于SSR分子标记的邻接法(Neighbor-Joining,NJ)聚类分析和基于农艺性状的类平均法(UPGMA)聚类分析。根据SSR分子标记数据,利用STRUCTURE 2.4对82份供试材料进行群体结构分析。【结果】61对SSR引物共检测出405条多态性谱带,其中,每对引物获得1—17条多态性谱带,平均每对引物检测出6.64条多态性谱带。82份亲本材料基于SSR分子标记、品质性状、农艺性状的Nei平均遗传距离分别为0.3499、0.2210和0.0270。基于SSR分子标记的邻接法(NJ)聚类分析将82份材料聚为7个类群。基于农艺性状、品质性状的类平均法(UPGMA)聚类分析均可将82份材料划分为一个较大的类群和三个较小的类群,但基于农艺性状和品质性状的聚类分析结果差异较大。基于SSR分子标记、品质性状和农艺性状的聚类分析均能将供试材料中来自不同地区的材料聚为同一类群,表明不同地理来源的供试材料间没有明显的遗传差异。遗传距离矩阵之间的相关性分析表明,基于SSR标记、品质和农艺性状的遗传距离矩阵间的相关性很小(r=0.0158),品质性状与农艺性状间呈负相关(r=-0.0411)。群体结构分析表明,当K值等于3时,ΔK取得最大值,说明82份材料可以划分为3个亚群。其中53份(64.63%)供试材料的Q值大于或等于0.6,分属于3个亚群。29份材料(35.37%)划分为混合亚群。群体结构分析的亚群划分结果与SSR聚类分析结果有一定相似性。【结论】供试亲本材料基因组水平的遗传多样性较为丰富,品质性状有一定差异,农艺性状差异较小。单独利用某一种标记或性状对亲本材料进行衡量都不全面,建议结合分子标记和多种表型性状,进行深入的遗传多样性和群体结构分析。

论文目录
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0 引言
1 材料与方法
  1.1 植物材料
  1.2 农艺性状调查
  1.3 品质性状测定
  1.4 DNA的提取及反应体系的构建
  1.5 SSR引物
  1.6 数据处理及聚类分析
  1.7 群体结构分析
2 结果
  2.1 SSR分子标记的多态性
  2.2 聚类分析
    2.2.1基于SSR分子标记的遗传距离
    2.2.2基于SSR分子标记的聚类分析
    2.2.3基于品质性状的聚类分析
    2.2.4基于农艺性状的聚类分析
  2.3 SSR、农艺性状、品质性状遗传距离矩阵之间的相关性分析
  2.4 群体结构分析与比较
3 讨论
  3.1 基于SSR的聚类分析表明供试材料中国内育成品种/系的遗传距离较大
  3.2 供试育种亲本的农艺性状、品质性状分析
  3.3 SSR、农艺性状、品质性状的相关性分析
  3.4 供试甘薯材料的群体结构分析
  3.5 群体结构分析与农艺性状、品质性状聚类的比较
4 结论
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