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利用核心SNP标记划分辽宁省常用玉米自交系杂种优势群的研究

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文献出处
玉米科学  2018年04期
机 构
沈阳农业大学,辽宁省植物基因工程技术中心,河北省承德市滦平县北山新区农牧局
基 金
辽宁省科技攻关项目“基于DOUGLAS基因型分析平台的玉米SNP标记体系的构建与优化”(2015103001)
关键词
玉米论文  单核苷酸多态性论文  杂种优势群论文  遗传相似度论文  聚类分析论文
论文摘要

利用3个密度的SNP标记对44份玉米自交系进行杂种优势群划分,包括8份对照自交系和36份辽宁省常用育种自交系。利用56k玉米芯片共筛选得到了46 899个高质量的SNP标记,作为高密度SNP标记划分杂种优势群,然后筛选1 008、101个SNP标记分别作为中密度和低密度SNP标记用于分群。结果表明,部分自交系的遗传相似度达到90%以上,不宜作为不同自交系进行育种应用。3个密度下的SNP标记都有效地将待测玉米自交系划分为4个杂种优势群,分别为瑞德群、兰卡斯特群、旅大红骨与塘四平头混合群以及类PH4CV群。对比高密度SNP标记,利用中低密度SNP标记划分的杂种优势群内部分自交系间的遗传距离发生变化,不能精确解析杂种优势群群内自交系的亲缘关系。划分杂种优势群可以采用中低密度的SNP育种芯片;群内自交系亲缘关系的区分应该采用高密度SNP芯片。

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