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膝关节骨性关节炎中退变半月板的生物信息学分析

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文献出处
中国组织工程研究  2021年29期
关键词
软骨论文  骨性关节炎论文  膝关节论文  半月板论文  软骨细胞论文  退变论文  基因论文  生物信息学论文  通路论文
论文摘要

背景:半月板退变是膝关节骨性关节炎的表现之一,但其具体的分子机制仍不清楚。目的:探讨骨性关节炎退变半月板可能的分子生物学机制。方法:采用五指山猪的前交叉韧带切除法制备半月板退变猪模型,应用基因芯片技术检测在退变半月板组织中的差异表达基因,运用GO分析、通路分析和核心基因网络分析来发现相关的调控网络。结果与结论:(1)研究共检测到差异表达基因893个,其中cyp2c33,gcnt7,ncdn,exd3,MUC13,ppp1r3d,nphp3,upb1,CD81和prph差异表达最显著;(2)GO分析中显示的一氧化氮生物合成过程的调节、通路分析中发现的TRP通道、核心基因网络分析中检测出的MDFI基因等在引起半月板退变过程可能发挥关键作用;(3)上述数据说明,实验建立了可靠的半月板退变的动物模型,比较完整地揭示了骨性关节炎半月板退变基因谱的差异表达基因和所涉及的生物学过程和信号通路,为未来该疾病的诊断和治疗提供分子靶标。

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文题释义:
0引言Introduction
1 材料和方法Materials and methods
  1.1 设计
  1.2 时间及地点
  1.3 材料
  1.4 实验方法
    1.4.1 分组、建模和取材
    1.4.2 基因芯片实验
    1.4.3 数据分析
    1.4.4 实时RT-PCR检测
    1.4.5 组织学观察
  1.5 主要观察指标
  1.6 统计学分析
2 结果Results
  2.1 实验动物数量分析
  2.2 样品质量
  2.3 骨关节炎组和假手术组差异表达基因变化
  2.4 骨关节炎组和假手术组差异表达基因GO分析结果
  2.5 骨关节炎组和假手术组差异表达基因的通路分析
  2.6 核心基因网络分析结果
  2.7 微阵列和RT-PCR结果比较
  2.8 猪关节半月板组织学变化
3 讨论Discussion
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