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蛋白质基因组学:进展、策略及问题

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文献出处
基因组学与应用生物学  2014年06期
机 构
东北农林大学盐碱地生物资源环境研究中心,海南省热带农业资源研究所,浙江农林大学暨阳学院,暨阳国际先进技术研究中心
基 金
海南省热带农业资源研究所微生物基因组测序及生物信息学研究项目资助
关键词
蛋白质基因组学论文  质谱论文  基因组注释论文  肽谱匹配论文  发现错误率论文
论文摘要

蛋白质基因组学(proteogenomics)是一种用来确定新肽的更综合的方法,不仅能在蛋白质水平上验证基因表达和基因精细模式,还能改进蛋白质序列数据库。本文首先总结了现有基因组注释方法,结合质谱技术的发展,详细介绍了基于质谱的蛋白质组学的研究进展;其次,我们还重点呈现和探讨了蛋白质基因组学研究中的蛋白质片段化问题,及质谱数据比对库的构建和肽与蛋白质的鉴定及验证;最后,进一步探讨了基于蛋白质基因组学的基因组注释方法的优缺点。

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