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利用ISSR分子标记构建南疆杏种质资源核心种质

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文献出处
果树学报  2015年03期
关键词
南疆论文  核心种质论文  位点优先取样策略论文  遗传距离论文  标记论文
论文摘要

【目的】探讨分子水平构建南疆杏核心种质的方法,建立最适核心种质。【方法】以138份南疆杏种质资源为材料,根据SM、Jaccard和Nei&Li遗传距离,采用UPGMA聚类法进行多次聚类,以随机取样策略为对照,利用位点优先取样策略研究核心种质构建的方法;采用丢失的等位基因数以及遗传多样性各指标进行t检验来确定最适构建方法;分别将核心种质与原种质和保留种质进行t检验和遗传多样性比较,以此来评价核心种质的代表性;并用主坐标轴分析法和表型性状对核心种质进行确认。【结果】位点优先取样策略优于随机取样策略;通过Jaccard遗传距离构建的核心种质要优于SM和Nei&Li遗传距离;采用主坐标轴分析法和表型数据分析显示,利用位点优先取样策略和Jaccard遗传距离构建的核心种质能够较全面的代表原种质的遗传多样性;31份核心种质资源,保留了原种质22.46%的样品,多态性位点数、多态性位点百分率、观测等位基因数、有效等位基因数、Nei’s遗传多样性指数和Shannon信息指数的保留率分别达到92.37%、97.62%、98.82%、102.52%、107.17%和106.36%。【结论】采用位点优先取样策略和Jaccard遗传距离进行多次聚类,是较适宜的构建南疆杏种质资源核心种质的方法,构建的31份核心种质能全面代表原种质的遗传多样性。

论文目录
关闭目录
1材料和方法
  1.1材料
  1.2分子试验方法
  1.3核心种质的构建
  1.4核心种质的评价
  1.5核心种质的确认
2结果与分析
  2.1南疆杏种质资源遗传多样性
  2.2位点优先取样策略和随机取样策略的比较
  2.3核心种质的评价
  2.4核心种质的确认
  2.5核心种质资源及亲缘关系
3讨论
  3.1取样策略与遗传距离
  3.2合理的取样比例
  3.3核心种质的评价与确认
4结论
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